Научно-производственное объединение «Микроген» образовано в мае 2003 года в результате слияния государственных предприятий, производящих медицинские иммунобиологические препараты и другие лекарственные средства. В соответствии с решением правительства Российской Федерации, объединение было создано с целью обеспечения потребности страны в профилактических, диагностических и лечебных иммунобиологических препаратах. Полномочия учредителя ФГУП «НПО «Микроген» до 2017 года осуществляло Министерство здравоохранения Российской Федерации.
В 2017 году в соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 17.03.2015 г. №139 «Об имущественном взносе Российской Федерации в Государственную корпорацию по содействию разработке, производству и экспорту высокотехнологичной промышленной продукции «Ростех», а также в рамках реализации предусмотренных законодательством России юридических преобразований ФГУП «НПО «Микроген» Минздрава России было преобразовано в акционерное общество «Научно-производственное объединение по медицинским иммунобиологическим препаратам «Микроген» (АО «НПО «Микроген»). Акции АО НПО «Микроген» находятся в федеральной собственности и переданы в качестве имущественного взноса Российской Федерации Госкорпорации Ростех.
В настоящее время в состав Общества входят 9 производственных площадок, расположенных в России, где работает более 5 тысяч специалистов.
Ассортиментный портфель предприятия насчитывает более 250 наименований продукции. В числе препаратов – вакцины и анатоксины, занимающие более 40% от общего объема производства продукции предприятия, лекарственные препараты бактериофаги и ботулинические токсины типа А, на долю которых приходится около 20%, препараты крови – 19% и готовые лекарственные средства – 10%.
АО «НПО «Микроген» является разработчиком уникальных отечественных лекарственных средств. В их числе первая российская комбинированная пентавакцина с бесклеточным коклюшным компонентом для профилактики сразу пяти заболеваний (дифтерия, столбняк, коклюш, гепатит B и гемофильная инфекция) и первая культуральная живая комбинированная вакцина, защищающая сразу от трех заболеваний (корь, паротит, краснуха).
Предприятие также является одним из ключевых российских производителей вакцин для сезонной профилактики гриппа, единственным в стране производителем ботулинических токсинов типа А, применяющихся в неврологической практике и косметологии, и лечебных препаратов бактериофагов – выпускает более 19 разновидностей лекарственных средств данного типа.
История филиалов АО «НПО «Микроген» напрямую связанна с истоками русской иммунологической науки и насчитывает более 100 лет, в частности, взяв свое начало с проведения прививки от бешенства вакциной, впервые изготовленной на Урале, и организации производства противодифтерийной, противодизентерийной, противоскарлатинозной сывороток; антирабической, скарлатинозной, холерной, тифозной, паратифозной и оспенной вакцин.